کتاب «بنیان اندیشۀ سیاسی اسلام در قرآن» پایاننامه مقطع دکتری جلیلی در دانشگاه امامصادق علیهالسلام است که در سال 1381 از آن دفاع شده است. این کتاب از سوی شرکت چاپ و نشر بینالملل منتشر شده است.
سعید جلیلی در یادداشتی درباره کتاب «سلولهای بهاری» نوشت: این کتاب به خوبی رمز لقمه حلال را در گشایش راز پیشرفت روایت میکند و آقا بودن را در ایمان و عمل صالح نشان میدهد.